Eine mögliche, aber seltene Komplikation nach einer offenen Kastration, ist eine sogenannte Samenstrangfistel. Eine Samenstrangfistel ist eine Infektion des zurückgebliebenen Samenstrangstumpfes. In der Folge fängt dieser an zu eitern und es bildet sich im Bereich der ursprünglichen Kastrationswunde eine sogenannte Fistel. Die Pferde zeigen manchmal einen klammen Gang oder eine Lahmheit und können auch Fieber entwickeln. Eine Samenstrangfistel muss chirurgisch angegangen werden. Das Pferd muss dafür in Allgemeinanästhesie gelegt werden.